Koszt programu szacowany jest na 37 mln euro. Całość prac została podzielona na trzy fazy. Etap I został zrealizowany do końca ubiegłego roku. Obecnie trwają prace nad realizacją II fazy, które muszą być zakończone do 2011 roku. Ostatni etap mający na celu całkowitą informatyzację Służby Celnej zrealizowany zostanie do 2013 roku.

Program e-cło oparty jest na unijnym programie e-custom, który obejmuje szereg przedsięwzięć informatycznych, prawnych i organizacyjnych mających na celu wyeliminowanie papierowej formy dokumentów w dziedzinie handlu i cła, przy jednoczesnym zapewnieniu odpowiedniego poziomu bezpieczeństwa handlu międzynarodowego.

Obecnie 80 proc. importu obsługiwane jest drogą elektroniczną. Wdrożono ok. 16 programów obsługujących tranzyt, import, eksport oraz akcyzę.